Трудові відносини членів виробничого кооперативу регулюються федеральним законом і статутом кооперативу, а найманих працівників - законодавством про працю. Кооператив самостійно визначає форми і системи оплати праці членів кооперативу та його найманих працівників. Оплата праці в кооперативі може здійснюватися в грошовій і (або) натуральній формі на підставі положення про оплату праці, що розробляється безпосередньо кооперативом. Кооператив самостійно встановлює для своїх членів види дисциплінарної відповідальності.
Дисциплінарні стягнення, в тому числі звільнення з посади, можуть бути накладені на голову кооперативу, членів правління кооперативу та членів ревізійної комісії (ревізора) тільки рішенням загальних зборів членів кооперативу, а на інших його посадових осіб - виконавчим органом кооперативу відповідно до статуту. Члени кооперативу, що приймають особисту трудову участь у його діяльності, підлягають соціальному та обов'язкового медичного страхування і соціального забезпечення нарівні з найманими працівниками кооперативу. Час роботи в кооперативі включається в трудовий стаж. Основним документом про трудову діяльність члена кооперативу є трудова книжка.
На членів кооперативу поширюються пільги, встановлені законодавством про працю. За рішенням загальних зборів кооператив має право за рахунок власного прибутку надавати додаткові пільги по соціальному забезпеченню своїх членів.
З найманими працівниками правління кооперативу укладає колективні або індивідуальні договори. Середня за звітний період чисельність найманих працівників у кооперативі не повинна перевищувати 30% чисельності членів кооперативу. Передбачені обмеження не поширюються на роботи, що виконуються за укладеними кооперативом з громадянами договорами підряду та іншими договорами, регульованим цивільним законодавством, а також на сезонні роботи.
Тривалість і розпорядок робочого дня в кооперативі, порядок надання вихідних днів, відпусток, в тому числі додаткових, а також інші умови праці визначаються правилами внутрішнього розпорядку кооперативу. При цьому тривалість відпусток повинна бути не менше встановленої законодавством про працю.
Кооператив здійснює заходи щодо забезпечення охорони праці, техніки безпеки, виробничої гігієни та санітарії у відповідності до положень і норм, що діють для державних унітарних підприємств.
У виробничих кооперативах оплата роботи кооператорів проводиться з праці, у споживчих кооперативах - залежно від участі в господарській діяльності кооперативу. У сільськогосподарському виробничому кооперативі прибуток кооперативу розподіляється наступним чином: на погашення прострочених боргів; в резервний фонд та інші неподільні фонди; для передбачених законодавством обов'язкових платежів до бюджету; на виплату дивідендів асоційованим членам кооперативу за їх додатковим внескам (не більше 30% від прибутку кооперативу); на кооперативні виплати.