Что касается до духовной жизни русского народа, его религиозного, нравственного и умственного развития, то в этом отношении правительственные мероприятия в царствование Анны Иоанновны незначительны. Они распадаются на две категории: а) по вопросам религиозным и б) по учреждению училищ. К первой категории относятся: преследование суеверий и расколов, охранение православной религии и распространение ее среди восточных и преимущественно поволжских инородцев. По всем этим рубрикам замечательны следующие распоряжения: строгое преследование колдунов и предание их смертной казни посредством сжигания (1731 г.); переселение малороссийских порубежных раскольников в дальние внутренние провинции и подчинение их монастырей надзору; относительно раскола старообрядства принимались еще следующие меры: во-первых, полемические сочинения против них; во-вторых, увещания духовными лицами, учениками известного "собеседника" со старообрядцами петровского времени нижегородского епископа Питирима (Авраамий у польской границы и Андроник в Костроме); в-третьих, "ревизии" и иногда просто разорение их скитов: в 1735 г. был разорен известный Ветковский скит на севере России, а в 1736 г. подверглись "ревизии" порубежные к Польше Стародубские слободы. Все эти меры, конечно, вели к совершенно противоположным результатам: раскол старообрядства усиливался и распространялся все более и более. Кроме раскола в царствование Анны Иоанновны укоренилась одна из известнейших в России религиозно-мистических сект — так называемой хлыстовщины или "людей Божиих", являющаяся как бы родоначальницей последующих таковых же лжеучений — скопцов, духоборцев и молокан. Среди высших слоев тогдашнего петербургского общества стала развиваться пропаганда лютеранская и римско-католическая, вследствие чего указом 1735 г. всем инославным христианам представлялась полная свобода исповедания, с непременным, однако, условием не распространять этих исповеданий среди православных. В 1730 году был подтвержден закон о принятии православия в известный срок татарскими мурзами в Казанской губ. и закон этот распространен на персиян, проживающих в пределах Русского государства; тех из них, которые не приняли православия, велено высылать из пределов России. Впрочем, запрещено, как персиян, так и пленных турок, обращать силой в православие (указы 1734 и 1739 гг.). Измена православию сурово наказывалась: в 1738 г. назначена смертная казнь за богохульство, и в том же году казнен смертью флота капитан-лейтенант Возницын за переход в иудейство. В деле распространения православия среди татар и финских инородцев Поволжья особенно выдается деятельность двух казанских архиепископов из южноруссов: Иллариона Рогалевского (1732—1735) и Луки Канашевича (1738—1755), а также архимандрита Богородицкого Свияжского монастыря Димитрия Сеченова, впоследствии известного митрополита новгородского (1757—1767). Среди калмыков в астраханской епархии успешно проповедовал православие Никодим Ленкевич.
Выше приведены были меры для образования шляхетства и солдатских детей; но это образование было исключительно профессиональным. Религиозно-нравственное образование (и то на бумаге, а не на деле) предполагалось только для духовенства. По инициативе Феофана Прокоповича и благодаря заботам епархиальных архиереев из южноруссов, в царствование Анны Иоанновны, в добавление к школам основанным при Петре Великом при архиерейских домах, заведены славяно-латинские школы, по типу южнорусских духовных школ, названных семинариями. Но в них учителя преподавали плохо, а учеников было мало, да и тех приходилось насильно загонять в школы. Вот перечень 16 городов, в которых открыты духовные семинарии в царствование Анны Иоанновны, с обозначением годов, в которые они были открыты: 1730 — Холмогоры; 1731 — Воронеж, Коломна; 1732 — Невский монастырь в С.-Петербурге; 1735 — Казань, Псков; 1735 — Вятка; 1738 — Нижний Новгород, Рязань, Тобольск, Устюг; 1739 — Вязьма, Тверь, Ростов; 1740 — Суздаль, Новгород. В Казанской губернии было открыто 4 школы для обучения русскому языку и православному вероучению поволжских инородцев.
От школ для духовенства естествен переход к материальному и нравственному положению самого духовенства в царствование Анны Иоанновны. Монахи, в особенности в глухих провинциальных монастырях, заподозривались в суеверии и ересях и строго за это преследовались. Монастырские и архиерейские вотчины терпели взыскания по недоимкам в государственных податях и сборах и были почти совершенно разорены. Положение белого духовенства было еще плачевнее. Священно — и церковнослужители преследовались за "небытие у присяги" при воцарении Анны Иоанновны, или за позднее ее принесение: их привлекали в Тайную канцелярию, били плетьми, брали в рекруты; а всех церковников (т. е. детей священно- и церковнослужителей, не имевших духовного сана), кроме обучавшихся в духовных школах, записывали в подушный оклад. От этого ряды белого духовенства редели: к 1740 г. оказалось 600 церквей без причтов.
