Итерационные алгоритмы имеют высокую вычислительную сложность. Наиболее простыми из них являются алгоритмы, использующие метод парных перестановок. Рассмотрим идею этого метода. Пусть множество вершин
разбито на два непересекающихся подмножества
и
, т.е. имеется начальная компоновка схемы на две подсхемы с некоторым значением ЦФ
. В соответствии с постановкой задачи разрезания перестановка вершин
и
целесообразна, если после этого значение ЦФ убывает. Для всех возможных обменов вершин
с вершинами
будем подсчитывать
и определять
.
Для определения
будем подсчитывать количества ребер, которые приходят в разрез и уходят из него при включении
в
и
в
. Перестановка вершин
и
вызывает изменение состояния только тех ребер, которые инцидентны этим вершинам. Для ребер, инцидентных вершине
возможны следующие состояния:
1. Останутся в разрезе между кусками
и
те ребра, которые содержат вершину
или хотя бы по одной вершине
и
.
2. Будут удалены из разреза между кусками
и
те ребра, которые не содержат вершины
и ни одной из вершин
. Множество вершин
, входящих в такое ребро
должно удовлетворять условию: 
3. Появятся в разрезе между кусками
и
те ребра, в которые не входили вершины из куска
. Для подмножеств вершин
таких ребер
должно выполняться условие: 
Аналогичные замечания справедливы и для ребер, инцидентных вершине
.
На основании изложенного приращение: 
где
и
- количество ребер, которые будут удалены из разреза при перестановке вершин
и
соответственно;
и
- количество ребер, которые появятся в разрезе при перестановке вершин
и
соответственно.
Основные пункты алгоритма итерационного улучшения парными перестановками вершин гиперграфа.
1. Для пары вершин
и
определяем инцидентные им ребра:
.
2. Находим множество вершин, входящих в каждое ребро: 
3. Подсчитываем показатели
,
,
,
.
4. Определяем приращение
.
5. Повторяем пп.1-4 для всех возможных парных обменов.
6. Находим
. Проверяем условие
. Если оно выполняется, то переходим к п.7, иначе – к п.8 (на окончание алгоритма).
7. Осуществляем перестановку вершин
и
, переходим к п.1.
8. Конец работы алгоритма.
Оценка сверху вычислительной сложности для данного алгоритма равна
.
Как уже отмечалось, перестановка вершин
и
изменит состояние только тех ребер, которые инцидентны этим вершинам, следовательно, после перестановки вершин показатели
и
не изменятся у тех вершин, которые не имели общих ребер с переставленными. Значит, после каждой итерации можно пересчитывать показатель
только для тех парных обменов, в которых хотя бы одна вершина имеет общие ребра хотя бы с одной из переставленных.
Определим вершины, для парных обменов которых необходимо пересчитывать
. Необходимо найти подмножества вершин, имеющие общие ребра с
и
, обозначим эти подмножества
и
.
Поскольку эти подмножества могут иметь общие вершины:
. Вершины
могут принадлежать как
, так и
. Разобьем
на два подмножества:
и
. Таким образом, показатели
будем пересчитывать для:

Доработаем алгоритм с учетом вышесказанного:
Первые 6 пунктов алгоритма останутся прежними. Приведем последующие пункты:
7. Осуществляем перестановку
и
.
8. Находим 
9. 
10. Переход к п.1, но в п.5 все возможные пары обменов будут:

11. Конец алгоритма.
Примечание: в п.6 переход на окончание алгоритма – к п.11.
Оценка сверху вычислительной сложности доработанного алгоритма равна
.