Карен Хорни подвергала критике как сексуальную окраску эдипова комплекса, так и мнение Фрейда о биологической детерминированности его возникновения, заявляя, что отсутствие биологической обусловленности феномена можно утверждать с уверенностью. Она также указывала, что эдипов комплекс является не первичным образованием и краеугольным фактором возникновения неврозов, а всего лишь реакцией ребенка на некоторые процессы в семейных отношениях: стремление матери сделать ребенка объектом слепой привязанности, наблюдение ребенком сексуальных сцен и т. д. В заключение одной из своих работ Хорни пишет:
«…Эдипов комплекс нельзя рассматривать как источник невроза, так как он сам является невротическим образованием».
То есть, по Хорни, эдипов комплекс является следствием невроза, а не его причиной. Еще одним пунктом критики Карен Хорни явилось понимание Фрейдом развития эдипова комплекса у девочек, которое она считала совершенно неправильным, «результатом искаженного понимания женской психологии» и «продуктом мужского нарциссизма».