Из-за многопротокольности и уменьшенного уровня ЦП и ОС, NAS имеет свои ограничения по сравнению с DAS/SAN системами. Если NAS занята слишком большим количеством пользователей, слишком большим количеством операций ввода/вывода или требования к мощности работы центрального процессора очень высокие, NAS достигает своих ограничений. Серверная система легко обновляется при добавлении одного или больше серверов в кластер, поэтому мощность ЦП может быть повышена, в то время как NAS ограничена в своем оборудовании, которое в большинстве случаев не модифицируется.
Некоторые устройства NAS не могут предоставить известные сервисы, типичные для файлового сервера или запускают их способом, который не есть эффективным. Примеры: способность вычислять использование диска отдельными директориями, возможность быстро индексировать файлы, возможность эффективно зеркалировать с помощью rsync. Можно использовать rsync, но через клиент NFS или CIFS; этот метод не срабатывает при перечислении больших файловых иерархий на номинальной скорости локальных дисков и включает значительный трафик сети.
Ключевое различие между DAS и NAS это то, что DAS это просто расширение до существующего сервера и она не объединена в сеть, в то время как NAS располагается в сети как собственный модуль; легче обменяться файлами при архитектуре NAS. NAS обычно имеет меньшую мощность ЦП и операций ввода /вывода по сравнению с DAS.