Епархия (на трех уровнях регион/район/населенный пункт, которым соответствует деление епархия/благочиние/приход) должна принимать активное участие в мониторинге и контроле результатов выбора родительским сообществом предметов (модулей) в рамках курса ОРКСЭ. Эта мера является необходимой, поскольку на этапе апробации 2009-2011 гг. имели место случаи давления на родителей с тем, чтобы они выбирали изучение «Основ светской этики» или «Основ мировых религиозных культур». Специалисты епархии должны интересоваться любым случаем низкого процента выбора курса ОПК по региону, в любом районе и любой школе.
Выбор каждого родителя должен быть удостоверен личным заявлением законного представителя, с указанием предмета, который выбран. Недопустимы листы, протоколы и т.п. коллективного выбора родителями в классе одного из предметов, так как именно через такие формы оказывалось давление на родителей. Указания о личном письменном заявлении родителей содержатся в официальных Методических материалах, направленных в регионы Министерством образования и науки России (на сайте ОРОИК РПЦ в разделе «В рамках федерального эксперимента»). Данная позиция согласована всеми участниками проекта.
По возможности, за каждым храмом должен быть закреплен ряд школ, с тем, чтобы священнослужители или, по их поручению, прихожане храма посещали родительские собрания и контролировали добровольность выбора родителями одного из предметов.
В случае обнаружения нарушений в процедуре выбора, епархия должна опротестовать их вначале на уровне органа управления образованием региона, а если это не даст положительного результата — на уровне администрации и главы региона с тем, чтобы родителям предоставили возможность свободно выбрать модуль для своего ребенка. Информация о существенных нарушениях или сигналы о невозможности конструктивно разрешить ситуацию должна быть направлена в Синодальный ОРОиК.