После того как network-based IDS размещены и функционируют, для увеличения уровня защиты системы дополнительно может быть рассмотрено использование host-based IDS. Однако инсталлирование host-based IDS на каждый хост может потребовать существенных временных затрат. Поэтому рекомендуется, чтобы в первую очередь host-based IDS были инсталлированы на критичных серверах. Это может уменьшить общую стоимость развертывания и позволит основное внимание уделить реагированию на тревоги, касающиеся наиболее важных хостов. После того как host-based IDS начали функционировать в обычном режиме, организации с повышенными требованиями к безопасности могут обсудить возможность инсталлирования host-based IDS на другие хосты. В этом случае следует приобретать host-based системы, которые имеют централизованное управление и функции создания отчетов. Такие возможности могут существенно понизить сложность управления сообщениями о тревогах от большого числа хостов.
Далее следует рассмотреть возможность повышения квалификации администраторов. В большинстве случаев эффективность конкретной host-based IDS зависит от возможности администратора различать ложные и верные тревоги.
Также важно (так как часто администратор не сопровождает постоянно host-based IDS) установить график проверки результатов IDS. Если это не сделано, риск, что противник изменит что-либо в IDS в течение осуществления атаки, возрастает.
