Rabie и др., 2005) у кур; и толерантность к трипаносоме у крупного рогатого скота (Hanotte и др., 2002).
За стадией картирования QTL обычно следует уточнение положения QTL на карте (QTL тонкое картирование). Для достижения этой цели анализируются дополнительные маркеры и все, представленные выше, дополнительные рекомбинационные события между ними в исследуемой области. Недавно был разработан и использован удачный подход для тонкого картирования области хромосомы BTA14, несущей существенный QTL для процента жира в молоке и других признаков (Farnir и др., 2002). В этом подходе использовалась история рекомбинаций в предыдущих поколениях для ограничения положения на карте небольшим участком в 3.8 cM (сантимограна); такой размер участка позволяет проводить позиционное клонирование гена (DGAT1) (Grisart и др., 2002). Вслед за тонким картированием среди генов, локализованных в выделенном районе, могут быть выявлены гены, определяющие проявление признака.Гены-кандидаты могут быть найдены у того же вида(например, когда имеется достаточно полная карта экспрессирующихся последовательностей - EST карта, или когда геном полностью секвенирован) или в ортологичных участках модельных организмов, для которых имеется полная геномная информация. Иногда ключевая информация о функции гена приходит из неожиданных источников. Так было с геном миостатина, функция которого была впервые установлена у мышей, а потом оказалось, что он локализуется у крупного рогатого скота в том районе хромосомы, где ранее был картирован ген синдрома двойной мускулатуры (McPherron, Lee, 1997). Ясно, что идентификация генов, отвечающих за фенотипические характеристики (гены количественных признаков – QTG), и функциональных мутаций (QTN) комплексных признаков все еще остается очень важной задачей, и необходимо разработать ряд подходов для того, чтобы уменьшить количество позиционированных на карте генов-кандидатов. В этом отношении определяющей является информация о функции гена. Однако, нам все еще не известна возможная функция(ии) большинства генов, идентифицированных в результате секвенирования геномов и кДНК (комплементарная ДНК). Именно поэтому исследование профилей генной экспрес сии в сочетании с описанным выше позиционным подходом может обеспечить появление полезной информации для идентификации генов-кандидатов,контролирующих комплексные признаки. Такой комбинированный подход определяется как генетическая геномика (Haley, de Koning, 2006). В настоящее время исследуются альтернативные подходы для выявления адаптивных генов с использованием генетических маркеров (вставка 77). Сейчас они находятся на экспериментальной стадии, и только дальнейшие исследования позволят оценить их плодотворность. Конечная цель картирования QTL состоит в идентификации QTG, и, в конечном счете, QTN. Хотя до настоящего времени у домашнего скота известно мало примеров, существуют мутации, которые могут оказать непосредственное воздействие на маркерную селекцию и на принятие решения о сохранении. По мере увеличения числа обнаруженных QTG и QTN в ближайшем будущем необходима разработка специальных моделей сохранения, учитывающих функциональные признаки и мутации.
http://www.fao.org/docrep/012/a1250r/a1250r17.pdf Разнообразие маркирования генетического материала в настоящее время достаточно велико, но в последние десятилетия очевидное преимущество получили молекулярные маркеры различных первичных последовательностей ДНК. Молекулярные маркеры, основанные на полиморфизме фрагментов ДНК и белков, позволяют успешно решать целый ряд задач: создания генетически обоснованных схем последовательной гибридизации различных форм растений; вопросов взаимодействия ядерного и цитоплазматических геномов; отбора и воспроизводства ценных генотипов; выявления хозяйственно-ценных и сортоспецифических ассоциаций генов, обусловливающих генетико-популяционную адаптацию к биотическим и абиотическим стрессам; сохранения генофондов растений; целенаправленной интрогрессии генетического материала от диких видов; регистрации и охраны авторских прав при создании сортов. Качественный скачок в решении задач картирования геномов растений, маркирования главных генов количественных признаков, выявления сортоспецифических особенностей генофондов растений, а также популяционно-генетических механизмов адаптации к локальным условиям разведения появились в связи с обнаружением гигантского полиморфизма на уровне фрагментов ДНК, в частности, микросателлитов и разработкой доступных методов анализа этого полиморфизма. Все это позволяет прогнозировать возрастающую роль молекулярных маркеров в решении задач селекции, семеноводства, сохранения биоразнообразия растений (19). Основанные на ДНК молекулярные маркеры начали привлекать внимание в конце 70-х после того, как Southern показал, как найти „специфические последовательности среди ДНК-фрагментов, разделенных гель-электрофорезом“. Другими словами, последние 20 лет показали, что ДНК-анализ трансформировался и стал широко применяться для удовлетворения различных потребностей человека и в медицине. В настоящее время молекулярные маркеры находят широкое применение в селекции растений, в первую очередь, в США (кукуруза, соя). В Европе эта работа проводится слабее. Одним из потенциальных препятствий для связей между селекционерами и генетиками может быть ставящее в тупик изобилие маркерных типов. http://www.agromage.com/stat_id.php?id=226
|