ДНК-МАРКЕРЫ В ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ: ТИПЫ МАРКЕРОВ, ИХ СВОЙСТВА И ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ
Ооооооо
ЗАШИФРОВАННЫЙ РИСУНОК
Упражнение дает ребятам первое знакомство с координатной сеткой. Аналогично известной игре «Морской бой» детям поочередно называются координаты точек, отмечаемые ими в пределах игрового поля. При внимательном и правильном нанесении всех точек в тетради появляются соответствующие зашифрованные рисунки. По мере освоения задания темп диктовки координат возрастает.
КАРТИНКА: ДОМИК
Упражнение «Зашифрованный рисунок»
Упражнение дает ребятам первое знакомство с координатной сеткой. Аналогично известной игре «Морской бой» детям поочередно называются координаты точек, отмечаемые ими в пределах игрового поля. При внимательном и правильном нанесении всех точек в тетради появляется соответствующий зашифрованный рисунок. По мере освоения задания темп диктовки координат возрастает.
ИНСТРУКЦИЯ: Нарисуй под мою диктовку. Скажи, что получилось?
А5, Б4, Б6, В4, В6, Г3, Г7, Д2, Д8, Е1, Е2, Е3, Е4, Е6, Е7, Е8, Е9, Ж4, Ж6, З4, З6, И3, И6, К2, К3, К4, К5.
КАРТИНКА: САМОЛЁТ
ДНК-МАРКЕРЫ В ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ: ТИПЫ МАРКЕРОВ, ИХ СВОЙСТВА И ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ
В обзоре рассмотрены разные типы ДНК-маркеров, их достоинства и недостатки, области применения. Показано, что использование в качестве маркерных систем полиморфных последовательностей ДНК, созданных на основе ПЦР, позволило решить проблему насыщения геномов маркерами и маркировать практически любые участки ДНК. Развитие высоко технологичных методов анализа полиморфизма ДНК привело к созданию нового типа маркеров (SNPs), объединяющего значительную часть ДНК-маркеров, ранее рассматривающихся как самостоятельные группы (ПЦР-ПДРФ, SSCP и др.). Рассматривается популярность различных типов молекулярных маркеров в различные периоды времени (с 1966 по 2003 г.г.) и предлагается прогноз на будущее. Предполагается, что в наше время происходит смена методологии научных исследований и переход к массовому скринингу образцов с использованием высоких технологий.
Успехи в развитии генетических исследований обусловлены наличием информативных генетических маркеров. Первоначально в качестве генетических маркеров использовались морфологические (фенотипические) признаки, например, с использованием маркеров этого типа в 1913 г. была построена первая генетическая карта (карта генома Drosophilla melanogaster). Однако количество информативных маркеров этого типа ограничено. Кроме того, морфологические признаки могут иметь сложный характер наследования и часто зависят от условий внешней среды [56]. Развитие молекулярных методов исследований позволило создать новые тест-системы, позволившие анализировать генетический полиморфизм на уровне продуктов генов (белковый или биохимический полиморфизм) и на уровне генетического материала клетки (полиморфизм ДНК).
Биохимические маркеры
Первыми молекулярными маркерами были маркеры, созданные на основе анализа белкового полиморфизма (биохимические маркеры) Использование нескольких сотен биохимических маркеров позволило оценить уровень генетического полиморфизма у более 2000 биологических видов (от микроорганизмов до человека) и разработать основные теоретические положения популяционной генетики [1, 43, 44, 60]. Однако в ходе исследований выяснились и ограничения в применении этого типа маркеров. Прежде всего, это то, что анализ белков позволяет исследовать полиморфизм только белок-кодирующих последовательностей и только у экспрессирующихся генов. Если учесть, что у высших эукариот всего около 1% генома составляют белок-кодирующие последовательности, очевидно, что от внимания исследователей ускользает основная часть генома. При этом из анализа исключаются такие функционально-значимые участки, как промоторные области, энхансеры, различные сайты регуляции, расположенные в интронах, нетранслируемых областях генов, а также вне генов, часто на значительном расстоянии от кодирующей последовательности.
Возможности указанного метода ограничиваются также низким уровнем белкового полиморфизма в популяциях домашних животных, птиц, культурных растений [19, 41, 91], ограничениями в выборе биологического материала и времени его сбора.
Более перспективным представляется использование в качестве маркерных систем полиморфных нуклеотидных последовательностей ДНК, позволяющих тестировать генетический полиморфизм непосредственно на уровне генов, а не на уровне продуктов генов, как в случае использования метода белкового полиморфизма. ДНК-маркеры позволяют решить проблему насыщения генома маркерами и маркировать практически любые участки ДНК, в том числе некодирующие. Кроме того, эта маркерная система дает возможность использовать для анализа любые ткани и органы, независимо от стадии развития организма и имеет целый ряд преимуществ по сравнению с другими типами маркеров (табл. 1).
| Таблица 1.
Свойства ДНК маркеров
| | Полезные свойства
| · Возможность тестирования любых последовательностей генома.
- Повсеместность распространения.
· Возможность анализа материнского типа наследования (митохондриальная ДНК).
- Возможность анализа отцовского типа наследования (Y-хромосома).
- Стабильность наследования.
- Отсутствие плейотропного эффекта.
- Множественность аллелей.
- Информативность о природе генетических изменений.
- Возможность проведения ретроспективных исследований.
| | Методическое удобство
| - Возможность определения в любых тканях.
- Возможность определения на любых стадиях развития.
- Длительность хранения образцов ДНК.
- Возможность использования гербарного материала, ископаемых остатков и т.п
| | Отсутствие ограничений в количестве маркеров
| - Отсутствие ограничений в числе маркеров на образец.
· Наличие маркеров для белок-кодирующих последовательностей.
· Наличие маркеров для некодирующих последовательностей (интронные, межгенные, регуляторные области и т.п.).
- Наличие маркеров для повторяющихся последовательностей
| | |
Аальтернативная стоимость. Кривая производственных возможностей В экономике Буридании есть 100 ед. труда с производительностью 4 м ткани или 2 кг мяса...
|
Вычисление основной дактилоскопической формулы Вычислением основной дактоформулы обычно занимается следователь. Для этого все десять пальцев разбиваются на пять пар...
|
Расчетные и графические задания Равновесный объем - это объем, определяемый равенством спроса и предложения...
|
Кардиналистский и ординалистский подходы Кардиналистский (количественный подход) к анализу полезности основан на представлении о возможности измерения различных благ в условных единицах полезности...
|
В теории государства и права выделяют два пути возникновения государства: восточный и западный Восточный путь возникновения государства представляет собой плавный переход, перерастание первобытного общества в государство...
Закон Гука при растяжении и сжатии
Напряжения и деформации при растяжении и сжатии связаны между собой зависимостью, которая называется законом Гука, по имени установившего этот закон английского физика Роберта Гука в 1678 году...
Характерные черты официально-делового стиля Наиболее характерными чертами официально-делового стиля являются:
• лаконичность...
|
Внешняя политика России 1894- 1917 гг. Внешнюю политику Николая II и первый период его царствования определяли, по меньшей мере три важных фактора...
Оценка качества Анализ документации. Имеющийся рецепт, паспорт письменного контроля и номер лекарственной формы соответствуют друг другу. Ингредиенты совместимы, расчеты сделаны верно, паспорт письменного контроля выписан верно. Правильность упаковки и оформления....
БИОХИМИЯ ТКАНЕЙ ЗУБА В составе зуба выделяют минерализованные и неминерализованные ткани...
|
|
