У некоторых растений стебли принимают вид листовой
пластинки,имеют зеленый цвет и выполняют функцию фотосинтеза (иглица). Такое видоизменение называется филлокладием. Когда же зеленые стебли несут редуцированные листья но сами не похожи на них, их называют кладодиями (спаржа). Иногда у растений наблюдается уродливость стебля — часть стеблей и соцветий становится сплюснутой (цикорий, ольха, ясень, бузина). Такое уродливое изменение стебля называется фасциацией.
Метаморфозы побега позволяют растениям переживать неблагоприятные для вегетации сезоны и служат вместилищем запасных питательных веществ: клубни, луковицы, корневища.
Клубни представляют собой сильно утолщенные мясистые подземные или надземные побеги. У подземных клубней листья редуцируются до мелких, рано спадающих чешуек, в пазухах которых находятся почки, называемые глазками (клубни картофеля). Надземные клубни образуются за счет сильного разрастания стебля и несут нормальные листья (капуста кольраби).
Луковица представляет собой, как и клубень, видоизмененный укороченный мясистый побег. Различают надземные и подземные луковицы. Подземные — у луковицы лука, чеснока. Нижняя часть луковицы представляет собой укороченный видоизмененный стебель, называемый донцем. К низу от донца образуются придаточные корни, а кверху видоизмененные листья (мясистые чешуи), в которых откладываются запасные питательные вещества.
Корневище — подземный видоизмененный побег. Внешне корневища напоминают корень, но оканчиваются они почкой, а не корневым чехликом. Корневища служат растениям для вегетативного размножения, и в них накапливаются различные вещества, используемые в промышленности и медицине (лапчатка, морена, валериана).