Главное управление состоит из 8 отделов, в состав которых входят структурные подразделения и подразделения обеспечения, а также 4 подведомственных государственных учреждения. Кроме того, в подчинении Главного управления будут находиться 18 Государственных учреждений «Пожарно-спасательный отряд» по району Санкт-Петербурга. Пожарно-спасательные отряды являются структурными подразделениями Противопожарной службы Санкт-Петербурга, финансируемой за счет средств бюджета города.:
- Санкт-Петербургское государственное образовательное учреждение “Учебно-методический центр по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям и пожарной безопасности Санкт-Петербурга”, где ежегодно проходят подготовку и переподготовку до 13 тысяч специалистов города по вопросам гражданкой обороны, защиты населения и пожарной безопасности;
- Санкт-Петербургское государственное унитарное предприятие “Экспертный центр” Главного управления по делам ГО и ЧС Санкт-Петербурга проводит выдачу исходных данных и требований по инженерно-техническим мероприятиям гражданской обороны и предупреждению чрезвычайных ситуаций для разработки проектов строительства жилищного, социально-бытового и промышленного назначения, государственную экспертизу проектов строительства объектов жилищного, социально-бытового и промышленного назначения в области защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций;
- Санкт-Петербургское государственное унитарное предприятие “Специальная инженерно-техническая служба” создано с целью ремонта дозиметрической аппаратуры, приборов радиационной и химической разведки, средств связи и других видов имущества гражданской обороны; лабораторной проверки, комплектации и консервации специального имущества гражданской обороны; градуировки приборов радиационной разведки и средств дозиметрического контроля; технической проверки и ремонта фильтровентиляционного оборудования защитных сооружений; хранения имущества гражданской обороны.
- Санкт-Петербургское государственное учреждение «Технический центр противопожарной службы Санкт-Петербурга» - Санкт-Петербургское государственное учреждение «Пожарно-спасательный отряд противопожарной службы Санкт-Петербурга по Московскому району Санкт-Петербурга» создан от имени субъекта РФ – города Санкт-Петербурга на основании постановления Правительства Санкт-Петербурга от 01.08.2005г. №1140. Отряд находится в ведении Главного управления по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Санкт-Петербурга, осуществляющего координацию и регулирование деятельности Отряда.
