При решении существующих проблем налогового администрирования, необходимо переработать нормы права направленные на установление ответственности налоговых органов в сторону ужесточения ответственности, а также предусмотреть персональную ответственность.
В целях решения проблемы многочисленных ошибок при осуществлении налогового контроля (например, необоснованный отказ принятия к вычету сумм налога) необходимо установить критерии оценки эффективности деятельности налоговых органов, условия премирования отдельных сотрудников и наложения взысканий, которые направлены на стимулирование сотрудников налоговых органов не проходить все судебные инстанции в случае заведомо проигрышного судебного дела (например, дела, аналогичного тому, по которому решение было принято и вступило в законную силу ранее), а также на стимулирование своевременного возврата излишне уплаченных (взысканных) налогов.
В настоящий момент ФНС России предпринято множество мер по совершенствованию работы налоговых органов, однако в настоящее время данные проблемы сохраняют свою актуальность, особенно в регионах Российской Федерации.
Указанные меры будут способствовать улучшению налогового законодательства, что окажет положительный эффект на экономику страны в целом.