Все извлечённые порции желудочного содержимого направляются в лабораторию, где определяют количество, цвет, консистенцию, запах, наличие примесей (желчь, слизь и др.). С помощью титрования желудочного сока 0,1Н раствором едкого натра определяют свободную и общую кислотность в каждой порции, а затем по формуле рассчитывают базальную и стимулированную продукцию (дебит) хлористоводородной кислоты.
К сожалению, на практике нередко приходится сталкиваться с ошибочными результатами фракционного зондирования. Чтобы их избежать, необходимо учитывать два обстоятельства. Во-первых, зонд после введения в желудок может занимать неправильное положение (сворачиваться, находиться в верхнем отделе желудка и т. д.). Поэтому, если при отсасывании получается мало желудочного содержимого, нужно сообщить об этом врачу. В этом случае с помощью рентгенологического исследования можно проверить положение зонда в желудке. Во-вторых, рекомендуемые до сих пор слабые стимуляторы желудочной секреции (например, капустный отвар, мясной бульон, кофеин и др.) объективно не отражают состояния желудочного кислотовыделения. В качестве стимулятора пользуются гистамином или (при наличии противопоказаний) пентагастрином.