Плазмиды. Плазмиды в большинстве случаев кольцевые, ковалентнозамкнутые, суперсперализованные молекулы ДНК. Существуют и линейные плазмиды: а) концы защищены белками, б) концы соединены ковалентно. ДНК плазмид составляет 0,1-5 % размера хромосомы. Плазмиды несут гены, необязательные для бактерий: а) гены устойчивости к антибиотикам, б) гены токсинов, в) гены, позволяющие бактериям использовать нетрадиционные субстраты. Для репликации плазмиды используют репликативный аппарат клетки. Репликация плазмид протекает независимо от репликации хромосомы. Трансмиссивные плазмиды – содержат гены, кодирующие образование половых пилей. Через пили передается молекула ДНК. Мобилизуемые плазмиды – не содержат tra-генов, но способны использовать аппарат конъюгации трансмиссивных плазмид. Космополитные плазмиды имеют широкий круг хозяев. Существуют плазмиды, способные существовать в клетках грамположительных и грамотрицательных бактериях.а также, способные реплицироваться в прокариотических клетках и в клетках дрожжей.
IS-элементы- наз инвертированные последовательнос, состоящие из 700- 1500п.н, IS-элементы несут лишь гены ответственные за транспозицию.
Транспозоны. Транспозоны обладают теми же свойствами, что и IS-элементы, но несут дополнительные гены: а) гены устойчивости к антибиотикам,б) гены токсинов,в) гены, позволяющие бактериям использовать нетрадиционные субстраты. Транспозон может быть построен как IS-элемент, но содержать дополнительные гены. Два IS-элемента, оказавшись рядом, могут перемещаться вместе, перенося заключенный между ними сегмент. Транспозоны и IS-элементы ответственны за ряд генетических явлений. Встраиваясь в какой-либо ген, они его инактивируют. Некоторые транспозоны и IS-элементы вызывают генетическую нестабильность поблизости своей локализации – повышается частота делеций и инверсий. IS-элементы способны вызвать транслокации, располагаясь рядом, они могут захватить и переносить ДНК хозяина. Мобильные элементы способны активировать ген, обеспечив транскрипцию со своего сильного промотора. Транспозоны и IS-элементы могут вызвать слияние репликонов и образование коинтеграта.