Для работы хроматографа с ионизационными детекторами необходимы: газ-носитель, водород и воздух. В качестве газа-носителя используют азот или наиболее устойчивый к ионизации инертный газ - гелий. Водород получают с помощью водородного генератора. Источником воздуха может быть как компрессор, так и баллон со сжатым газом. В блоке подготовки газов находятся ловушки с силикагелем, предназначенные для осушки газов. Требуемая для работы скорость газов устанавливается на каждой линии раздельно игольчатыми вентилями точной регулировки и измеряется на выходе из блока расходомером. Соотношение количества инертного газа, водорода и воздуха для пламенно-ионизационного детектора составляет 1:1:10. Скорости подачи водорода и воздуха должны быть соответственно (25-30) и (400-500) см3/мин., а инертного газа - около 30 см3/мин. В случае работы с набивными колонками необходимое количество инертного газа поступает в детектор из газохроматографической колонки.
Использование капиллярных колонок, работающих при объемной скорости (0,3-3,0) см3/мин. (в зависимости от диаметра и температуры газохроматографической колонки, давления газа носителя на входе), требует введения в поток газа, поступающего в горелку детектора дополнительного количества инертного газа выше для соблюдения указанного соотношения.
Для этой цели используют дополнительную линию, через тройник в линию подается около 30 см3/мин. инертного газа.