Студопедия Главная Случайная страница Обратная связь

Разделы: Автомобили Астрономия Биология География Дом и сад Другие языки Другое Информатика История Культура Литература Логика Математика Медицина Металлургия Механика Образование Охрана труда Педагогика Политика Право Психология Религия Риторика Социология Спорт Строительство Технология Туризм Физика Философия Финансы Химия Черчение Экология Экономика Электроника

Общие принципы номенклатуры и классификации ферментов




 

В настоящее время известно около трех тысяч химических реакций, катализируемых ферментами. Чтобы ориентироваться в таком разнообразии, необходима систематизированная классификация и номенклатура, которой могли бы пользоваться биохимики всех стран. Основные принципы международной классификации и номенклатуры ферментов были разработаны в 1964 году комиссией по ферментам, созданной при международном биохимическом союзе.

В основу классификации положен тип реакции, катализируемой ферментом. По этому принципу все ферменты разделены на 6 классов. Ферменты каждого класса делят на подклассы, объединяя в них ферменты, действующие на субстраты сходного строения. Подклассы разбивают на подподклассы, в которых уточняют структуру химических групп, отличающих субстраты друг от друга. Внутри подподклассов перечисляют относящиеся к ним ферменты. Таким образом, каждый фермент получает свой кодовый номер, состоящий из четырех чисел, разделенных точками. Например, глутаминаза (L-глутамин-амидогидролаза) имеет номер 3.5.1.2. Первое число обозначает класс, второе – подкласс, третье – подподкласс, четвертое – номер фермента в пределах подподкласса. Такой способ нумерации ферментов позволяет помещать вновь открытый фермент в конце соответствующего подподкласса без изменения нумерации других ферментов. Точно также при выделении новых подклассов и подподклассов их можно добавлять без нарушения порядка нумерации ранее установленных подразделений.

Ферменты имеют систематическое и рабочее название. Систематическое название составляется из двух частей. Первая часть содержит название субстрата или субстратов, вторая – с окончанием «аза» - указывает на природу катализируемой реакции. Дополнительная информация о реакции при необходимости приводится в скобках в конце названия. Систематическое название присваивается только ферментам, каталитическое действие которых полностью изучено.

Рабочее название фермента короче систематического, с минимальной детализацией. В ряде случаев в качестве рабочего может быть использовано тривиальное название фермента. В научных публикациях при первом упоминании о ферменте принято указывать его систематическое название и кодовый номер, а в дальнейшем пользоваться рабочим названием фермента.

Особенности номенклатуры отдельных классов ферментов приводятся в таблице 1.


 

 

Название Класса Тип реакции и ее схема Систематическое название фермента Пример реакции, название фермента
    Оксидо-редуктазы   Окислительно-восстановительная реакция АН2+В = А+ВН2   В – акцептор протонов, коферменты НАД+, ФАД и др.   Донор: акцептор – оксидоредуктаза   Этанол: НАД+ - оксидоредуктаза     сукцинат: ФАД - оксидоредуктаза  
    Гидролазы   Реакция гидролиза А-В+Н2О=А-Н + В-ОН   Субстрат: отщепляемая группа – гидролаза     L-глутамат-амидогидролаза  
    Изомеразы   Реакция изомеризации А=А1   Субстрат – изомераза (либо указывают тип реакции Изомеризации)     УДФ-гдюкозо-4-эпимераза  

Табл.1. Номенклатура и классификация ферментов

 


 

Название Класса Тип реакции и ее схема Систематическое название фермента Пример реакции, название фермента
    Лиазы   Реакция распада А-В=А+В с образованием или разрывом двойной связи     Субстрат: отщепляемая группа – лиаза     L–малат – гидролиаза  
    Лигазы   Реакция синтеза органических соединений за счет распада АТФ А+В+АТФ= А-В+АДФ+Ф или А+В+АТФ= А-В+АМФ+Ф-Ф     Субстрат 1: субстрат 2 – лигаза (АДФ) или (АМФ)   L-глутамат: NH3 – лигаза (АДФ)
    Трансферазы   Реакция переноса функциональной группы от одного вещества к другому АХ+В=А+ВХ Х – переносимая группа.     Донор: акцептор – переносимая группа- трансфераза     L-аспартат: a-кетоглутарат – аминотрансфераза

 

 







Дата добавления: 2014-10-22; просмотров: 1787. Нарушение авторских прав


Рекомендуемые страницы:


Studopedia.info - Студопедия - 2014-2020 год . (0.002 сек.) русская версия | украинская версия