Номенклатура и классификация

2 названия-короткое(рабочие)+систематическое, применяемое для однозначной идентификации фермента

 

Рабочие названия

суффикс "аза", присоединённый к названию субстрата реакции(уреаза, сахараза, липаза, нуклеаза) или к названию химического превращения определённого субстрата(лактатдегидрогеназа, аденилатциклаза, фосфо-глюкомутаза). Согласно российской классификации ферментов (КФ), названия ферментов пишутся слитно.

 

Классы ферментов

 

все ферменты разбиты на 6 основных классов в зависимости от типа катализируемой химической реакции. Каждый класс состоит из многочисленных подклассов и подподклассов с учётом преобразуемой химической группы субстрата, донора и акцептора преобразуемых группировок, наличия дополнительных молекул и т.д. Каждый из 6 классов имеет свой порядковый номер, строго закреплённый за ним.

 

v 1.Оксидоредуктазы

 

Катализируют различные окислительно-восстановительные реакции с участием 2 субстратов (перенос е- или атомов водорода с одного субстрата на другой).

 

Систематическое наименование ферментов составляют по формуле "донор: акцептороксидоредуктаза", рабочее - субстрат-подкласс оксидоредуктаз.

 

Ø Дегидрогеназы.

Катализируют реакции дегидрирования (отщепления водорода). В качестве акцепторов электронов используются коферменты NAD+, NADP+, FAD, FMN. Все ферменты этой группы обладают высокой субстратной специфичностью.

 

Малат+ NAD⁺<малатдегидрогеназа>àоксалоацетат+ NAD+Н⁺

 

Ø Оксидазы

Акцептором электрона служит молекулярный кислород

 

 

Ø Оксигеназы (гидроксилазы) - атом кислорода из молекулы кислорода присоединяется к субстрату

 

Дофамин+O₂à ^{<дофамингидроксилаза>}àнорадреналин

 

v 2.Трансферазы

 

§ Катализируют перенос функциональных групп от одного соединения к другом

§ Подразделяют в зависимости от переносимой группы.

§ Название этих ферментов составляют по формуле "донор: ацетр-транспортируемая группатрансфераза"

 

Аланин+альфа-кетоглутаратà ^{<аланин-альфа-кетоглутарат аминотрансфераза>} àпируват+глутаминовая к-та

v 3.Гидролазы

§ Реакции гидролиза (расщепления ковалентной связи с присоединением молекулы воды по месту разрыва).

§ Подразделяют в зависимости от расщепляемой связи.

§ Наименование ферментов составляют по формуле "субстрат-гидролаза" или прямым присоединением к названию субстрата суффикса "аза", например протеаза, липаза, фосфолипаза, рибо-нуклеаза

 

v 4. Лиазы

 

§ К лиазам относят ферменты, отщепляющие от субстратов негидролитическим путём определённую группу (при этом могут отщепляться СО2, Н2О, NH2,SН2и др.) или присоединяющие чаще всего молекулу воды по двойной связи.

 

§ Наименование ферментов "субстрат-отщепляемая или присоединяемая группировка"(фумаратгидратаза-присоединение к фумарату воды с образованием малата)

 

v 5. Изомеразы

 

§ Катализируют различные внутримолекулярные превращения. Подразделяют в зависимости от типа реакции изомеризации.

§ Когда изомеризация состоит во внутримолекулярном переносе группы, фермент называют "мутазой

 

v 6. Лигазы (синтетазы)

 

§ Реакции присоединения друг к другу двух молекул с образованием ковалентной связи. Этот процесс сопряжён с разрывом фосфоэфирной связи в молекуле АТФ (или других нуклеозидтрифосфатов) или с разрывом макроэргических связей других соединений. В первом случае (при использовании энергии гидролиза АТФ) такие ферменты называют лигазами

 

§ В случае, когда источником энергии служит любое другое макроэргическое соединение (не АТФ), ферменты называют синтазами (цитратсинтаза-образование цитрата из Ацетил-КоА и оксалоацитата)